Николай Сапрыгин родился в семье мелкого военного чиновника. Рано осиротел (в 4 года) и воспитывался у старшего брата в Казани. Окончил Казанскую вторую мужскую гимназию (1898) еще занимаясь в гимназии, включился в революционную борьбу. В 1892 году он вошел в кружок молодых рабочих, читал рекомендованную ему нелегальную литературу по рабочему движению. В 1898 году поступил в Казанский университет на  физико-математический факультет. Весной 1899 года за участие в студенческом «академическом» движении (сходки, забастовки, обструкции) из университета был исключен, но затем снова принят с условием полностью подчиняться правилам университета.В марте 1901 года за участие в совместной политической демонстрации студентов и рабочих Сапрыгина арестовывают, на месяц заключают в тюрьму и отчисляют из университета.

Революционная деятельность

• С 1902 года — член казанской организации «Красный Крест», которая помогала ссыльным и заключенным.
• В 1903 году Николай Евменьевич стал одним из руководителей Казанского комитета РСДРП (Российская социал-демократическая рабочая партия). 
• В июне 1903 года Сапрыгин арестован за революционную деятельность (за составление и печатание прокламаций.) и выслан в Вологодскую губернию, где продолжал распространять листовки и организовывать социал-демократические кружки. Ссылку отбывал в Яренске, Великом Устюге,  В Яренске Н. Е. Сапрыгин участвует в протесте ссыльных – отказе от манифеста по случаю рождения наследника.
• В ноябре 1904 года его переводят из Яренска в город Великий Устюг. Здесь за участие в первомайской демонстрации 1905 года он снова привлекается к ответственности и попадает под чрезвычайный надзор полиции.
• Осенью 1906 года Сапрыгин вернулся в Казань. Сделал попытку окончить университет, поступив на четвертый курс, но вскоре был исключен за «неблагонадежность».
• С 1907 по 1912 год он работает на Казанском пороховом заводе. Сначала слесарем, а затем мастером и ни на один день не прекращает своей революционной деятельности. И вновь ссылка, на этот раз в Архангельскую губернию, Печорский уезд под гласный надзор полиции сроком на два года.
• 28 марта 1913 года Н. Е. Сапрыгин по этапу был доставлен в Архангельск. Местом ссылки ему определили печорское село Усть-Цильму. С прибытием туда Сапрыгин вместе с другими ссыльными большевиками организует социализмом архангельской кружок, который поддерживал тесную идейную и организационную связь с кружком Калмыкова на лесопильном заводе «Стелла Поларе» (ныне Печорский лесопильный завод в г. Нарьян-Маре). 
• В 1915 году срок ссылки истек, и Сапрыгин, по предложению главной физической обсерватории, остается работать наблюдателем опорной метеорологической станции на Печоре, не далеко от Усть-Цильмы. 

Советский период

В сентябре 1918 года Н. Е. Сапрыгин выезжает в Архангельск, чтобы с семьей вернуться в Казань, но военная интервенция на Севере помешала осуществлению этого замысла. Николай Евменьевич становится членом Архангельской подпольной большевистской организации, в которой он работал до весны 1919 года.

После разгрома большевистского комитета Сапрыгин, спасаясь от контрразведки, уезжает на Печору. Здесь он ведет агитацию среди крестьян против белогвардейцев, поднимает народ на восстание. За неделю до освобождения Архангельска восставшие крестьяне одержали победу (об этом сообщалось в оперативной сводке военно-революционного комитета Пиньевского-Мезенского района от 23 февраля 1920 года).

• В 1920 году в Ижме организовался ревком Печоры, и Сапрыгин становится членом Печорского уездного военревкома.
• В 1922–1923 годах редактировал газету «Трудовой Север», которая с 7 ноября 1922 года стала называться «Волной».
• С 1924 по 1931 год Сапрыгин трудился на посту председателя комитета содействия малым народностям северных окраин при Архтубисполкоме, а затем – крайисполкоме. В этот период (1925) он избирался делегатом XIV съезда ВКП(6).
• С 1931–1938 гг. (в этот период Сапрыгин работал в Восточной Сибири в г. Иркутске, куда в 1931 году переехал по предложению Комитета содействия малым народностям Севера при Президиуме ВЦИК).

Много сделал Н.Е. Сапрыгин для развития Ненецкого национального (ныне Ненецкого автономного) округа. В декабре 1920 года он, как секретарь Печорского укома РКП (6), участвует в работе первого съезда самоедов Большеземельской и Малоземельской тундр. На нем он рассказал трудящимся далекой северной окраины о Советской власти, о Ленине, о той новой жизни, которую начали строить рабочий класс и трудовое крестьянство России под руководством партии большевиков. Ненцы Большеземельской и Малоземельской тундр, как и все трудящиеся Печорского уезда, избирают Сапрыгина делегатом на 8-й Всероссийский съезд Советов. Здесь, на съезде, он слушал Владимира Ильича Ленина.

Сапрыгин всячески поддерживал стремление ненцев к национальному самоуправлению. Под его непосредственным руководством в Неси и Тельвиске были организованы самоедские Волисполкомы.

Вопросы хозяйственного развития Ненецкого края, постановка в нем школьного образования, приобщение ненцев к социалистической культуре – все эти вопросы находят самое широкое отражение в работе комитета, который он возглавлял.

Одним из первых направлений, где Сапрыгин развернул активную деятельность, стала медицина. Кочевники веками страдали от болезней, а детская смертность по самым скромным оценкам медиков превышала 50%. В 1925 году по инициативе Комитета Севера (где Сапрыгин играл ключевую роль) были направлены два медицинских отряда Российского общества Красного Креста в Большеземельскую тундру. В 1926–1927 годах в тундру отправились передвижные медико-санитарные отряды Наркомата здравоохранения – отряд №3 с базой в селе Тельвисочное и отряд №10 при культбазе Хоседа-Хард. В населённых пунктах открыли стационарные больницы и амбулатории: к 1929 году функционировало 4 больницы на 26 коек.

Поначалу ненцы относились к медикам с недоверием, но ситуация быстро менялась. Уже в 1926 году удовлетворённый Н.Е. Сапрыгин писал: «Самоеды обращаются за медицинской помощью, осознают ее необходимость и пользу». На базе врачебных пунктов формировалась система медицинского обслуживания, включавшая больницы в центрах сезонного скопления оленеводов и разъездные бригады, кочующие с туземными Советами. Сапрыгин отдавал себе отчёт, что предпринятых мер недостаточно для огромных тундровых районов, но считал их первыми, пусть и маленькими, победами.

Самым ярким эпизодом, раскрывающим Сапрыгина как чуткого и дальновидного политика, стала его встреча с молодым ненцем Антоном Петровичем Пыреркой (тундровое имя Сярати). В июле 1926 года, возвращаясь через Архангельск, Пырерка получил приглашение зайти к Николаю Евменьевичу Сапрыгину. «Уточнив анкетные данные Антона, старый большевик сразу заявил в лоб: – Есть мнение послать Вас, товарищ Пырерка, на учебу в Москву, в Коммунистический университет. Вы из бедняков, сирота, сами батрачили на кулаков, комсомолец. Курсы вот успешно закончили. Кому как не Вам строить новую жизнь в тундре. Кстати, в Москве уже учатся самоеды из Колвы - Лымин Афанасий, Высоких Максим. Будет поначалу, конечно, тяжело, но закалка у Вас крепкая, пролетарская – выдюжите...»

Сапрыгин не просто предлагал – он лично продвигал молодого ненца, видя в нём будущего лидера. Результатом стало «казённое» направление № 1450 от 27 июля 1926 года с печатью и подписью заведующего административным отделом Куджиева: «Архангельский губком ВКП(б) командирует тов. Пырерка Антона Петровича в Коммунистический университет трудящихся Востока им. тов. Сталина в счет предоставляемых ЦК ВКП(б) мест». Так началась новая жизнь Пырерки – и это было прямым результатом кадровой политики Сапрыгина.

В феврале 1927 года Н.Е. Сапрыгин обратился с письмом в Комитет Севера при ВЦИК. Он высказал следующую мысль: «постоянные избы-читальни больших положительных результатов в деле просвещения взрослого самоедского населения не дадут, так как самоед приезжает в эти организации раз-два года». Наиболее целесообразным способом в деле постановки массовой работы среди взрослого самоедского населения и молодежи комитет считает организацию кочевого Красного чума…, которые имели бы возможность весной и осенью останавливаться в местах массовых кочеваний самоедов и летом – в местах наибольшего скопления на берегах океана и его заливов».

Эта идея Сапрыгина получила поддержку Н.К. Крупской и вскоре была воплощена им в жизнь.

В 1927 году на страницах журнала «Северное хозяйство» (№ 9–10, с. 89) Сапрыгин опубликовал программную статью «Самоеды при Советской власти». В ней он без прикрас констатировал: «Первые годы Советской власти на Севере не принесли существенных изменений в жизни самоедов. Тундровой кулак ускользал от слабых еще окраинных советов и продолжал свои гнусные операции, недостаток забрасываемого для тундр продовольствия и разверстка создания среди самоедов недоброкачественного отношения к Советской власти». Эти слова стали не просто констатацией факта, а программой действий: Сапрыгин понимал, что без решительного вмешательства, без образования, медицины и экономической поддержки коренное население так и останется в плену вековых традиций, предрассудков и кулацкой эксплуатации.

Много сделал Николай Евменьевич для развития печати на Севере. Он сам был редактором газет: 

• В 1921 году «Красная Печора».
• В 1922 году «Трудовой Север» (затем «Волна»).
• В 1922 году и до 1931 года был бессменным редактором журнала «Северное хозяйство». Кроме того, в 20-е годы он являлся корреспондентом РОСТА от Печорского уезда.

Ненецкие работники часто писали Сапрыгину не официально, а по‑свойски: «Здравствуй, Николай Евменьевич…».

Во многом благодаря немногочисленному комитету Ненецкий национальный округ и организован.

Последние годы своей жизни (1939–1942) Николай Евменьевич Сапрыгин работал в Архангельском областном государственном архиве научным сотрудником.

Николай Сапрыгин умер в 1942 году в возрасте 64 лет.

Его именем названа одна из первых улиц в Нарьян-Маре — центре Ненецкого автономного округа, в создании которого он сыграл ключевую роль. 24 марта 1958 г ул. Красная площадь была переименована в ул. Сапрыгина. Протяженность улицы Сапрыгина почти 800 метров на ней в разное время располагались да и находятся до сей поры здание гидрографии, гостиница морских лётчиков и моряков (потом детский сад, ясли с 1934 по 2003 гг.), клуб «Моряков» (1930 – 1940 гг.) рыбинспекция, речной причал и речной вокзал.

Дочь Николая Евменьевича Сапрыгина, Ирина Николаевна, впоследствии работала учителем в Оксино, Тельвиске, Нарьян-Маре. Внучка - Людмила Васильевна Галушина (Киселёва) в 1966—69 диктор окружного радио, в 1980-х — корреспондент, редактор Ненецкой окружной редакции радиовещания. Внучка - Светлана Васильевна Сапрыгина преподавала в Ненецкой школе-интернате в 1980-х.